Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU6

ZNF778, Zinc finger protein 778, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF778Q96MU6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF778Q96MU6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF778Q96MU6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF778Q96MU6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF778Q96MU6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF778Q96MU6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF778Q96MU6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF778Q96MU6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF778Q96MU6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF778Q96MU6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms