Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNPC3Q96LT9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNPC3Q96LT9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNPC3Q96LT9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNPC3Q96LT9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNPC3Q96LT9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNPC3Q96LT9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNPC3Q96LT9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNPC3Q96LT9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNPC3Q96LT9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNPC3Q96LT9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNPC3Q96LT9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNPC3Q96LT9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNPC3Q96LT9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNPC3Q96LT9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms