Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 CLEC2D-209ENST00000476198 981 ntTSL 57.09□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CLEC2D-213ENST00000536355 571 ntTSL 46.95□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CLEC2D-204ENST00000325960 1552 ntTSL 26.82□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CLEC2D-212ENST00000492359 541 ntTSL 46.71□□□□□ -1.344e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.44e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CLEC2D-211ENST00000487752 287 ntTSL 56.31□□□□□ -1.44e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CLEC2D-208ENST00000466035 778 ntTSL 35.33□□□□□ -1.564e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CLEC2D-210ENST00000479877 1855 ntTSL 25.24□□□□□ -1.574e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.724e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.724e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.234e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 ERO1A-203ENST00000554019 2094 ntTSL 528.06■■■□□ 2.089e-15■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 ERO1A-202ENST00000553714 672 ntTSL 29.19□□□□□ -0.949e-15■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.881e-8■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.041e-8■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 TP53RK-202ENST00000372114 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 MPHOSPH10-204ENST00000493360 1584 ntTSL 211.75□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -11e-8■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.141e-8■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.254e-11■■■■■ 33.6
FUBP3Q96I24 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.652e-20■■■■■ 33.6
FUBP3Q96I24 DKK1-204ENST00000494277 465 ntTSL 54.71□□□□□ -1.662e-20■■■■■ 33.6
FUBP3Q96I24 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 33.5
FUBP3Q96I24 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.274e-13■■■■■ 33.4
FUBP3Q96I24 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.596e-7■■■■■ 33.2
FUBP3Q96I24 UBE2N-205ENST00000550657 3018 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 33.2
FUBP3Q96I24 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-10■■■■■ 33.2
FUBP3Q96I24 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.644e-10■■■■■ 33.2
FUBP3Q96I24 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.193e-12■■■■■ 33.1
FUBP3Q96I24 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.043e-12■■■■■ 33.1
FUBP3Q96I24 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.993e-12■■■■■ 33.1
FUBP3Q96I24 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.533e-12■■■■■ 33.1
FUBP3Q96I24 WRNIP1-201ENST00000380764 1557 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.463e-12■■■■■ 33.1
FUBP3Q96I24 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.364e-7■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.364e-7■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.434e-7■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.474e-7■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.524e-7■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 ITFG1-211ENST00000568047 2636 ntTSL 57.16□□□□□ -1.269e-7■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 ITFG1-202ENST00000537184 1422 ntTSL 25.54□□□□□ -1.529e-7■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 ELMSAN1-208ENST00000476562 5314 ntTSL 220.69■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 33
FUBP3Q96I24 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.036e-8■■■■■ 32.9
FUBP3Q96I24 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 32.9
FUBP3Q96I24 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 32.9
FUBP3Q96I24 EDEM3-203ENST00000439962 2872 ntTSL 1 (best)4.86□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 32.9
FUBP3Q96I24 ERO1A-206ENST00000556039 1855 ntTSL 531.52■■■□□ 2.643e-15■■■■■ 32.9
FUBP3Q96I24 ZNF516-204ENST00000543743 682 ntTSL 216.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 32.8
FUBP3Q96I24 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 32.7
FUBP3Q96I24 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.774e-16■■■■■ 32.6
FUBP3Q96I24 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.244e-16■■■■■ 32.6
FUBP3Q96I24 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.586e-8■■■■■ 32.5
FUBP3Q96I24 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.586e-8■■■■■ 32.5
FUBP3Q96I24 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.646e-8■■■■■ 32.5
FUBP3Q96I24 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 32.5
FUBP3Q96I24 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.33e-15■■■■■ 32.4
FUBP3Q96I24 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.343e-15■■■■■ 32.4
FUBP3Q96I24 LDLR-214ENST00000560628 535 ntTSL 310.93□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 32.3
FUBP3Q96I24 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.448e-20■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 320.94■□□□□ 0.942e-15■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.913e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 518.54■□□□□ 0.563e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.53e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.183e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.333e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 AGPAT3-215ENST00000484865 588 ntTSL 212.8□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 LINC00511-214ENST00000581801 379 ntTSL 311.7□□□□□ -0.543e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 AGPAT3-211ENST00000467358 3955 ntTSL 210.86□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 TMX3-201ENST00000299608 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 KIF2A-201ENST00000381103 3360 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.742e-15■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 LINC00511-210ENST00000580861 467 ntTSL 49.46□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 SMYD3-217ENST00000493441 823 ntTSL 29.3□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 SMYD3-212ENST00000483072 466 ntTSL 29.25□□□□□ -0.933e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 SMYD3-201ENST00000366516 1863 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -13e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.063e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 SMYD3-202ENST00000366517 1372 ntTSL 1 (best)7.96□□□□□ -1.143e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 SMYD3-209ENST00000470510 1042 ntTSL 57.88□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.773e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.783e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.783e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.843e-8■■■■■ 32.2
FUBP3Q96I24 SMYD3-215ENST00000490322 368 ntTSL 33.32□□□□□ -1.883e-8■■■■■ 32.2
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 293.3 ms