Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF653Q96CK0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF653Q96CK0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF653Q96CK0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF653Q96CK0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF653Q96CK0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF653Q96CK0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF653Q96CK0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF653Q96CK0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF653Q96CK0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF653Q96CK0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF653Q96CK0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZNF653Q96CK0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF653Q96CK0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF653Q96CK0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF653Q96CK0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF653Q96CK0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF653Q96CK0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF653Q96CK0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF653Q96CK0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF653Q96CK0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF653Q96CK0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF653Q96CK0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF653Q96CK0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF653Q96CK0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF653Q96CK0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF653Q96CK0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF653Q96CK0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF653Q96CK0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF653Q96CK0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF653Q96CK0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF653Q96CK0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF653Q96CK0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF653Q96CK0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF653Q96CK0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF653Q96CK0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF653Q96CK0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms