Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
IGSF1Q8N6C5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
IGSF1Q8N6C5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
IGSF1Q8N6C5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IGSF1Q8N6C5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IGSF1Q8N6C5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IGSF1Q8N6C5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IGSF1Q8N6C5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
IGSF1Q8N6C5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
IGSF1Q8N6C5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
IGSF1Q8N6C5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
IGSF1Q8N6C5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
IGSF1Q8N6C5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
IGSF1Q8N6C5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
IGSF1Q8N6C5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
IGSF1Q8N6C5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
IGSF1Q8N6C5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
IGSF1Q8N6C5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
IGSF1Q8N6C5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
IGSF1Q8N6C5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
IGSF1Q8N6C5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
IGSF1Q8N6C5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
IGSF1Q8N6C5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
IGSF1Q8N6C5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
IGSF1Q8N6C5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
IGSF1Q8N6C5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IGSF1Q8N6C5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IGSF1Q8N6C5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IGSF1Q8N6C5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IGSF1Q8N6C5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
IGSF1Q8N6C5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IGSF1Q8N6C5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
IGSF1Q8N6C5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
IGSF1Q8N6C5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms