Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL3Q8IVW4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKL3Q8IVW4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKL3Q8IVW4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKL3Q8IVW4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKL3Q8IVW4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKL3Q8IVW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKL3Q8IVW4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL3Q8IVW4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL3Q8IVW4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL3Q8IVW4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKL3Q8IVW4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKL3Q8IVW4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKL3Q8IVW4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL3Q8IVW4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL3Q8IVW4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL3Q8IVW4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL3Q8IVW4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms