Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM139Q8IV31 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM139Q8IV31 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM139Q8IV31 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM139Q8IV31 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM139Q8IV31 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM139Q8IV31 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM139Q8IV31 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM139Q8IV31 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM139Q8IV31 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM139Q8IV31 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM139Q8IV31 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM139Q8IV31 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM139Q8IV31 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM139Q8IV31 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM139Q8IV31 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM139Q8IV31 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms