Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRIP3Q6Q6R5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRIP3Q6Q6R5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRIP3Q6Q6R5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRIP3Q6Q6R5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRIP3Q6Q6R5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms