Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SUMO4Q6EEV6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUMO4Q6EEV6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO4Q6EEV6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SUMO4Q6EEV6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms