Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC183Q5T5S1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC183Q5T5S1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC183Q5T5S1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC183Q5T5S1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC183Q5T5S1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC183Q5T5S1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC183Q5T5S1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC183Q5T5S1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC183Q5T5S1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC183Q5T5S1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC183Q5T5S1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC183Q5T5S1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC183Q5T5S1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC183Q5T5S1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC183Q5T5S1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC183Q5T5S1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC183Q5T5S1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC183Q5T5S1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC183Q5T5S1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC183Q5T5S1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC183Q5T5S1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC183Q5T5S1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC183Q5T5S1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC183Q5T5S1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC183Q5T5S1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC183Q5T5S1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC183Q5T5S1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC183Q5T5S1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms