Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNYL2Q5T2Q4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNYL2Q5T2Q4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNYL2Q5T2Q4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNYL2Q5T2Q4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNYL2Q5T2Q4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms