Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPAT3Q53EU6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAT3Q53EU6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAT3Q53EU6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAT3Q53EU6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAT3Q53EU6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms