Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC184Q52MB2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC184Q52MB2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC184Q52MB2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC184Q52MB2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC184Q52MB2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC184Q52MB2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC184Q52MB2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC184Q52MB2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC184Q52MB2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC184Q52MB2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC184Q52MB2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC184Q52MB2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC184Q52MB2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC184Q52MB2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC184Q52MB2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC184Q52MB2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC184Q52MB2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC184Q52MB2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC184Q52MB2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC184Q52MB2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC184Q52MB2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC184Q52MB2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC184Q52MB2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC184Q52MB2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC184Q52MB2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CCDC184Q52MB2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC184Q52MB2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC184Q52MB2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC184Q52MB2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC184Q52MB2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC184Q52MB2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC184Q52MB2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC184Q52MB2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC184Q52MB2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC184Q52MB2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC184Q52MB2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC184Q52MB2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms