Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R3AQ16821 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP1R3AQ16821 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R3AQ16821 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP1R3AQ16821 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP1R3AQ16821 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms