Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIK5Q16478 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIK5Q16478 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIK5Q16478 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIK5Q16478 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIK5Q16478 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIK5Q16478 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GRIK5Q16478 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIK5Q16478 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIK5Q16478 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIK5Q16478 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIK5Q16478 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIK5Q16478 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIK5Q16478 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIK5Q16478 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIK5Q16478 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIK5Q16478 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIK5Q16478 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIK5Q16478 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIK5Q16478 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
GRIK5Q16478 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GRIK5Q16478 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GRIK5Q16478 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIK5Q16478 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIK5Q16478 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
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