Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NCOA1Q15788 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
NCOA1Q15788 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NCOA1Q15788 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
NCOA1Q15788 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NCOA1Q15788 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
NCOA1Q15788 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NCOA1Q15788 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NCOA1Q15788 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NCOA1Q15788 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
NCOA1Q15788 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
NCOA1Q15788 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
NCOA1Q15788 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.86■■■■□ 3.97
NCOA1Q15788 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NCOA1Q15788 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NCOA1Q15788 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NCOA1Q15788 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NCOA1Q15788 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NCOA1Q15788 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NCOA1Q15788 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
NCOA1Q15788 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
NCOA1Q15788 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.8■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
NCOA1Q15788 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
NCOA1Q15788 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
NCOA1Q15788 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
NCOA1Q15788 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
NCOA1Q15788 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NCOA1Q15788 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NCOA1Q15788 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NCOA1Q15788 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NCOA1Q15788 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NCOA1Q15788 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NCOA1Q15788 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NCOA1Q15788 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NCOA1Q15788 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NCOA1Q15788 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NCOA1Q15788 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
NCOA1Q15788 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NCOA1Q15788 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NCOA1Q15788 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NCOA1Q15788 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
NCOA1Q15788 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NCOA1Q15788 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NCOA1Q15788 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NCOA1Q15788 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NCOA1Q15788 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NCOA1Q15788 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NCOA1Q15788 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NCOA1Q15788 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NCOA1Q15788 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NCOA1Q15788 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
NCOA1Q15788 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
NCOA1Q15788 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
NCOA1Q15788 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NCOA1Q15788 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
NCOA1Q15788 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
NCOA1Q15788 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NCOA1Q15788 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NCOA1Q15788 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
NCOA1Q15788 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
NCOA1Q15788 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NCOA1Q15788 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
NCOA1Q15788 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
NCOA1Q15788 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
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