Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRJQ12913 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRJQ12913 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRJQ12913 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRJQ12913 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRJQ12913 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRJQ12913 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRJQ12913 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRJQ12913 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRJQ12913 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRJQ12913 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRJQ12913 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRJQ12913 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRJQ12913 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRJQ12913 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRJQ12913 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRJQ12913 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRJQ12913 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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