Protein–RNA interactions for Protein: Q12330

SME1, Small nuclear ribonucleoprotein E, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SME1Q12330 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 YGR012WYGR012W 1182 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 HBS1YKR084C 1836 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 FET5YFL041W 1869 nt7.24□□□□□ -1.25
SME1Q12330 THI72YOR192C 1800 nt7.23□□□□□ -1.25
SME1Q12330 YDR455CYDR455C 309 nt7.23□□□□□ -1.25
SME1Q12330 EAF3YPR023C 1206 nt7.23□□□□□ -1.25
SME1Q12330 YDR306CYDR306C 1437 nt7.23□□□□□ -1.25
SME1Q12330 PRY1YJL079C 900 nt7.22□□□□□ -1.25
SME1Q12330 LSB5YCL034W 1065 nt7.22□□□□□ -1.25
SME1Q12330 SAM3YPL274W 1764 nt7.21□□□□□ -1.25
SME1Q12330 MDL2YPL270W 2322 nt7.21□□□□□ -1.26
SME1Q12330 OYE2YHR179W 1203 nt7.21□□□□□ -1.26
SME1Q12330 SAC7YDR389W 1965 nt7.2□□□□□ -1.26
SME1Q12330 ERG13YML126C 1476 nt7.19□□□□□ -1.26
SME1Q12330 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.19□□□□□ -1.26
SME1Q12330 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.19□□□□□ -1.26
SME1Q12330 RBG1YAL036C 1110 nt7.19□□□□□ -1.26
SME1Q12330 RPT5YOR117W 1305 nt7.19□□□□□ -1.26
SME1Q12330 NPP2YEL016C 1482 nt7.18□□□□□ -1.26
SME1Q12330 YMR265CYMR265C 1386 nt7.18□□□□□ -1.26
SME1Q12330 LOT5YKL183W 921 nt7.17□□□□□ -1.26
SME1Q12330 SDH5YOL071W 489 nt7.17□□□□□ -1.26
SME1Q12330 DAK2YFL053W 1776 nt7.17□□□□□ -1.26
SME1Q12330 LSM5YER146W 282 nt7.16□□□□□ -1.26
SME1Q12330 GND1YHR183W 1470 nt7.16□□□□□ -1.26
SME1Q12330 DUR3YHL016C 2208 nt7.15□□□□□ -1.26
SME1Q12330 YDR467CYDR467C 327 nt7.15□□□□□ -1.26
SME1Q12330 RRT8YOL048C 1029 nt7.15□□□□□ -1.26
SME1Q12330 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.15□□□□□ -1.26
SME1Q12330 GAL2YLR081W 1725 nt7.15□□□□□ -1.27
SME1Q12330 GNP1YDR508C 1992 nt7.14□□□□□ -1.27
SME1Q12330 RPN14YGL004C 1254 nt7.14□□□□□ -1.27
SME1Q12330 YJL118WYJL118W 660 nt7.13□□□□□ -1.27
SME1Q12330 ORT1YOR130C 879 nt7.13□□□□□ -1.27
SME1Q12330 HAP5YOR358W 729 nt7.13□□□□□ -1.27
SME1Q12330 MTO1YGL236C 2010 nt7.13□□□□□ -1.27
SME1Q12330 TPS1YBR126C 1488 nt7.12□□□□□ -1.27
SME1Q12330 RAD23YEL037C 1197 nt7.12□□□□□ -1.27
SME1Q12330 SMM1YNR015W 1155 nt7.12□□□□□ -1.27
SME1Q12330 HXT11YOL156W 1704 nt7.12□□□□□ -1.27
SME1Q12330 YNR064CYNR064C 873 nt7.11□□□□□ -1.27
SME1Q12330 FIT1YDR534C 1587 nt7.11□□□□□ -1.27
SME1Q12330 PUS7YOR243C 2031 nt7.1□□□□□ -1.27
SME1Q12330 DDI1YER143W 1287 nt7.1□□□□□ -1.27
SME1Q12330 TMA23YMR269W 636 nt7.1□□□□□ -1.27
SME1Q12330 SUV3YPL029W 2214 nt7.09□□□□□ -1.27
SME1Q12330 ELO1YJL196C 933 nt7.09□□□□□ -1.27
SME1Q12330 TRP2YER090W 1524 nt7.09□□□□□ -1.27
SME1Q12330 GTB1YDR221W 2109 nt7.09□□□□□ -1.28
SME1Q12330 THI6YPL214C 1623 nt7.09□□□□□ -1.28
SME1Q12330 UFD1YGR048W 1086 nt7.08□□□□□ -1.28
SME1Q12330 KEL3YPL263C 1956 nt7.08□□□□□ -1.28
SME1Q12330 IMO32YGR031W 1029 nt7.07□□□□□ -1.28
SME1Q12330 YBL095WYBL095W 813 nt7.07□□□□□ -1.28
SME1Q12330 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.06□□□□□ -1.28
SME1Q12330 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.06□□□□□ -1.28
SME1Q12330 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.06□□□□□ -1.28
SME1Q12330 TOK1YJL093C 2076 nt7.06□□□□□ -1.28
SME1Q12330 RIB7YBR153W 735 nt7.06□□□□□ -1.28
SME1Q12330 RIB3YDR487C 627 nt7.05□□□□□ -1.28
SME1Q12330 YJR114WYJR114W 393 nt7.05□□□□□ -1.28
SME1Q12330 GPM1YKL152C 744 nt7.05□□□□□ -1.28
SME1Q12330 HXT12YIL170W 1374 nt7.05□□□□□ -1.28
SME1Q12330 DUS3YLR401C 2007 nt7.05□□□□□ -1.28
SME1Q12330 snR31snR31 225 nt7.04□□□□□ -1.28
SME1Q12330 ADE16YLR028C 1776 nt7.04□□□□□ -1.28
SME1Q12330 POP2YNR052C 1302 nt7.03□□□□□ -1.28
SME1Q12330 EMC3YKL207W 762 nt7.03□□□□□ -1.28
SME1Q12330 snR4snR4 186 nt7.03□□□□□ -1.28
SME1Q12330 SRM1YGL097W 1449 nt7.01□□□□□ -1.29
SME1Q12330 GAL3YDR009W 1563 nt7.01□□□□□ -1.29
SME1Q12330 AAT1YKL106W 1356 nt7.01□□□□□ -1.29
SME1Q12330 YMR210WYMR210W 1350 nt7.01□□□□□ -1.29
SME1Q12330 ADE8YDR408C 645 nt7.01□□□□□ -1.29
SME1Q12330 CRC1YOR100C 984 nt7.01□□□□□ -1.29
SME1Q12330 YLR072WYLR072W 2082 nt7□□□□□ -1.29
SME1Q12330 LSB3YFR024C-A 1380 nt7□□□□□ -1.29
SME1Q12330 VRG4YGL225W 1014 nt7□□□□□ -1.29
SME1Q12330 YJL055WYJL055W 738 nt7□□□□□ -1.29
SME1Q12330 SFL1YOR140W 2301 nt6.99□□□□□ -1.29
SME1Q12330 OPI3YJR073C 621 nt6.99□□□□□ -1.29
SME1Q12330 YMC2YBR104W 990 nt6.99□□□□□ -1.29
SME1Q12330 DIA4YHR011W 1341 nt6.99□□□□□ -1.29
SME1Q12330 FRA1YLL029W 2250 nt6.98□□□□□ -1.29
SME1Q12330 LPD1YFL018C 1500 nt6.97□□□□□ -1.29
SME1Q12330 CAB5YDR196C 726 nt6.97□□□□□ -1.29
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