Protein–RNA interactions for Protein: Q12330

SME1, Small nuclear ribonucleoprotein E, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SME1Q12330 NSR1YGR159C 1245 nt16.29■□□□□ 0.2
SME1Q12330 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.83■□□□□ 0.12
SME1Q12330 NOP1YDL014W 984 nt15.24■□□□□ 0.03
SME1Q12330 MDJ1YFL016C 1536 nt14.88□□□□□ -0.03
SME1Q12330 YJL027CYJL027C 417 nt13.72□□□□□ -0.21
SME1Q12330 YKL036CYKL036C 393 nt13.53□□□□□ -0.24
SME1Q12330 SRX1YKL086W 384 nt13.3□□□□□ -0.28
SME1Q12330 Q0297Q0297 156 nt13.17□□□□□ -0.3
SME1Q12330 DBP2YNL112W 1641 nt12.99□□□□□ -0.33
SME1Q12330 YBR190WYBR190W 312 nt12.91□□□□□ -0.34
SME1Q12330 SSA3YBL075C 1950 nt12.66□□□□□ -0.38
SME1Q12330 RTC3YHR087W 336 nt12.52□□□□□ -0.41
SME1Q12330 YCR051WYCR051W 669 nt12.51□□□□□ -0.41
SME1Q12330 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.35□□□□□ -0.43
SME1Q12330 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.35□□□□□ -0.43
SME1Q12330 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.35□□□□□ -0.43
SME1Q12330 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.35□□□□□ -0.43
SME1Q12330 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.35□□□□□ -0.43
SME1Q12330 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.35□□□□□ -0.43
SME1Q12330 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.35□□□□□ -0.43
SME1Q12330 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.35□□□□□ -0.43
SME1Q12330 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.35□□□□□ -0.43
SME1Q12330 CCC1YLR220W 969 nt12.13□□□□□ -0.47
SME1Q12330 PUT4YOR348C 1884 nt12.12□□□□□ -0.47
SME1Q12330 RVS167YDR388W 1449 nt12.11□□□□□ -0.47
SME1Q12330 SCS3YGL126W 1143 nt12□□□□□ -0.49
SME1Q12330 SCJ1YMR214W 1134 nt11.9□□□□□ -0.5
SME1Q12330 RPP1BYDL130W 321 nt11.79□□□□□ -0.52
SME1Q12330 ARE1YCR048W 1833 nt11.72□□□□□ -0.53
SME1Q12330 YOL085CYOL085C 342 nt11.72□□□□□ -0.53
SME1Q12330 POA1YBR022W 534 nt11.65□□□□□ -0.54
SME1Q12330 SHR5YOL110W 714 nt11.57□□□□□ -0.56
SME1Q12330 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.55□□□□□ -0.56
SME1Q12330 SAH1YER043C 1350 nt11.54□□□□□ -0.56
SME1Q12330 URN1YPR152C 1398 nt11.54□□□□□ -0.56
SME1Q12330 BSC6YOL137W 1494 nt11.53□□□□□ -0.56
SME1Q12330 PKP1YIL042C 1185 nt11.53□□□□□ -0.56
SME1Q12330 OPI9YLR338W 858 nt11.52□□□□□ -0.57
SME1Q12330 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.48□□□□□ -0.57
SME1Q12330 SPT5YML010W 3192 nt11.46□□□□□ -0.58
SME1Q12330 DEP1YAL013W 1218 nt11.32□□□□□ -0.6
SME1Q12330 RPN10YHR200W 807 nt11.3□□□□□ -0.6
SME1Q12330 PET122YER153C 765 nt11.29□□□□□ -0.6
SME1Q12330 SSA4YER103W 1929 nt11.28□□□□□ -0.6
SME1Q12330 BUD23YCR047C 828 nt11.21□□□□□ -0.61
SME1Q12330 PUN1YLR414C 792 nt11.2□□□□□ -0.62
SME1Q12330 YNL208WYNL208W 600 nt11.18□□□□□ -0.62
SME1Q12330 YDJ1YNL064C 1230 nt11.16□□□□□ -0.62
SME1Q12330 PTC2YER089C 1395 nt11.1□□□□□ -0.63
SME1Q12330 NAB2YGL122C 1578 nt11.07□□□□□ -0.64
SME1Q12330 SCR1SCR1 522 nt11.06□□□□□ -0.64
SME1Q12330 YJR018WYJR018W 363 nt10.99□□□□□ -0.65
SME1Q12330 BDF1YLR399C 2061 nt10.93□□□□□ -0.66
SME1Q12330 RRN5YLR141W 1092 nt10.92□□□□□ -0.66
SME1Q12330 GAR1YHR089C 618 nt10.91□□□□□ -0.66
SME1Q12330 MEP2YNL142W 1500 nt10.9□□□□□ -0.66
SME1Q12330 FIS1YIL065C 468 nt10.86□□□□□ -0.67
SME1Q12330 DAL1YIR027C 1383 nt10.81□□□□□ -0.68
SME1Q12330 TAT1YBR069C 1860 nt10.78□□□□□ -0.68
SME1Q12330 INM2YDR287W 879 nt10.71□□□□□ -0.69
SME1Q12330 YPS1YLR120C 1710 nt10.7□□□□□ -0.7
SME1Q12330 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.7□□□□□ -0.7
SME1Q12330 PHO4YFR034C 939 nt10.7□□□□□ -0.7
SME1Q12330 YJR120WYJR120W 351 nt10.7□□□□□ -0.7
SME1Q12330 FPR4YLR449W 1179 nt10.7□□□□□ -0.7
SME1Q12330 DCW1YKL046C 1350 nt10.66□□□□□ -0.7
SME1Q12330 RPP2BYDR382W 333 nt10.64□□□□□ -0.71
SME1Q12330 TIR1YER011W 765 nt10.6□□□□□ -0.71
SME1Q12330 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.59□□□□□ -0.71
SME1Q12330 ATS1YAL020C 1002 nt10.59□□□□□ -0.71
SME1Q12330 SSA1YAL005C 1929 nt10.57□□□□□ -0.72
SME1Q12330 YDR095CYDR095C 411 nt10.56□□□□□ -0.72
SME1Q12330 YMR090WYMR090W 684 nt10.56□□□□□ -0.72
SME1Q12330 YJL225CYJL225C 5277 nt10.55□□□□□ -0.72
SME1Q12330 EMI2YDR516C 1503 nt10.55□□□□□ -0.72
SME1Q12330 YBR220CYBR220C 1683 nt10.55□□□□□ -0.72
SME1Q12330 RSB1YOR049C 1065 nt10.51□□□□□ -0.73
SME1Q12330 Q0182Q0182 405 nt10.49□□□□□ -0.73
SME1Q12330 YBL100CYBL100C 315 nt10.48□□□□□ -0.73
SME1Q12330 YDL221WYDL221W 552 nt10.44□□□□□ -0.74
SME1Q12330 PAC11YDR488C 1602 nt10.43□□□□□ -0.74
SME1Q12330 SDH1YKL148C 1923 nt10.42□□□□□ -0.74
SME1Q12330 PTP1YDL230W 1008 nt10.36□□□□□ -0.75
SME1Q12330 RPP2AYOL039W 321 nt10.35□□□□□ -0.75
SME1Q12330 BDH2YAL061W 1254 nt10.34□□□□□ -0.75
SME1Q12330 FUN26YAL022C 1554 nt10.34□□□□□ -0.75
SME1Q12330 CAC2YML102W 1407 nt10.33□□□□□ -0.76
SME1Q12330 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.31□□□□□ -0.76
SME1Q12330 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.31□□□□□ -0.76
SME1Q12330 SEC11YIR022W 504 nt10.3□□□□□ -0.76
SME1Q12330 ALF1YNL148C 765 nt10.3□□□□□ -0.76
SME1Q12330 PCH2YBR186W 1695 nt10.29□□□□□ -0.76
SME1Q12330 SCC4YER147C 1875 nt10.27□□□□□ -0.77
SME1Q12330 GUT2YIL155C 1950 nt10.26□□□□□ -0.77
SME1Q12330 SRB2YHR041C 633 nt10.25□□□□□ -0.77
SME1Q12330 TRM9YML014W 840 nt10.22□□□□□ -0.77
SME1Q12330 IRC15YPL017C 1500 nt10.22□□□□□ -0.77
SME1Q12330 SIS1YNL007C 1059 nt10.19□□□□□ -0.78
SME1Q12330 CCT6YDR188W 1641 nt10.18□□□□□ -0.78
SME1Q12330 GIS3YLR094C 1509 nt10.15□□□□□ -0.78
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