Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC18A2Q05940 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC18A2Q05940 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC18A2Q05940 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A2Q05940 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A2Q05940 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC18A2Q05940 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A2Q05940 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A2Q05940 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC18A2Q05940 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC18A2Q05940 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC18A2Q05940 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC18A2Q05940 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC18A2Q05940 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A2Q05940 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC18A2Q05940 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC18A2Q05940 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A2Q05940 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms