Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS28P62857 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS28P62857 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS28P62857 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS28P62857 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS28P62857 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS28P62857 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS28P62857 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS28P62857 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS28P62857 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS28P62857 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS28P62857 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS28P62857 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS28P62857 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS28P62857 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS28P62857 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS28P62857 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS28P62857 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS28P62857 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPS28P62857 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPS28P62857 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPS28P62857 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPS28P62857 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPS28P62857 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPS28P62857 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPS28P62857 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPS28P62857 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPS28P62857 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPS28P62857 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPS28P62857 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPS28P62857 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RPS28P62857 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS28P62857 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS28P62857 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS28P62857 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS28P62857 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS28P62857 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS28P62857 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS28P62857 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS28P62857 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS28P62857 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS28P62857 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS28P62857 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS28P62857 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS28P62857 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS28P62857 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS28P62857 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS28P62857 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS28P62857 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS28P62857 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS28P62857 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS28P62857 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS28P62857 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS28P62857 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS28P62857 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS28P62857 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS28P62857 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS28P62857 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS28P62857 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS28P62857 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS28P62857 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS28P62857 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS28P62857 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS28P62857 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS28P62857 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS28P62857 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS28P62857 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS28P62857 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS28P62857 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS28P62857 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS28P62857 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS28P62857 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS28P62857 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS28P62857 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS28P62857 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS28P62857 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS28P62857 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS28P62857 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS28P62857 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS28P62857 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS28P62857 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS28P62857 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS28P62857 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS28P62857 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS28P62857 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS28P62857 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS28P62857 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS28P62857 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS28P62857 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS28P62857 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS28P62857 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS28P62857 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS28P62857 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS28P62857 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS28P62857 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS28P62857 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS28P62857 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS28P62857 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS28P62857 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS28P62857 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms