Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP9P55211 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP9P55211 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP9P55211 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP9P55211 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP9P55211 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP9P55211 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP9P55211 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP9P55211 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP9P55211 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP9P55211 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP9P55211 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP9P55211 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP9P55211 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP9P55211 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP9P55211 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP9P55211 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP9P55211 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP9P55211 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP9P55211 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP9P55211 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP9P55211 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP9P55211 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP9P55211 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP9P55211 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP9P55211 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP9P55211 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP9P55211 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP9P55211 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP9P55211 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP9P55211 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP9P55211 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP9P55211 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP9P55211 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP9P55211 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP9P55211 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP9P55211 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP9P55211 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP9P55211 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP9P55211 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP9P55211 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP9P55211 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP9P55211 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP9P55211 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP9P55211 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP9P55211 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP9P55211 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP9P55211 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP9P55211 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP9P55211 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP9P55211 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP9P55211 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP9P55211 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP9P55211 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP9P55211 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP9P55211 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP9P55211 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP9P55211 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP9P55211 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP9P55211 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP9P55211 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP9P55211 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP9P55211 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP9P55211 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP9P55211 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP9P55211 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP9P55211 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP9P55211 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP9P55211 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP9P55211 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP9P55211 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP9P55211 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP9P55211 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP9P55211 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP9P55211 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP9P55211 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP9P55211 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP9P55211 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP9P55211 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP9P55211 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP9P55211 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP9P55211 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP9P55211 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP9P55211 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP9P55211 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP9P55211 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP9P55211 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP9P55211 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP9P55211 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP9P55211 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP9P55211 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP9P55211 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP9P55211 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP9P55211 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP9P55211 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP9P55211 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP9P55211 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP9P55211 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP9P55211 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP9P55211 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms