Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
AFDNP55196 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
AFDNP55196 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
AFDNP55196 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
AFDNP55196 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
AFDNP55196 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
AFDNP55196 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
AFDNP55196 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
AFDNP55196 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
AFDNP55196 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
AFDNP55196 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
AFDNP55196 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
AFDNP55196 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
AFDNP55196 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
AFDNP55196 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
AFDNP55196 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
AFDNP55196 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
AFDNP55196 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
AFDNP55196 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
AFDNP55196 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
AFDNP55196 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
AFDNP55196 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
AFDNP55196 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
AFDNP55196 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
AFDNP55196 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
AFDNP55196 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
AFDNP55196 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
AFDNP55196 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
AFDNP55196 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
AFDNP55196 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
AFDNP55196 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
AFDNP55196 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
AFDNP55196 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
AFDNP55196 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
AFDNP55196 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
AFDNP55196 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
AFDNP55196 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
AFDNP55196 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
AFDNP55196 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
AFDNP55196 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
AFDNP55196 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
AFDNP55196 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
AFDNP55196 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
AFDNP55196 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
AFDNP55196 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
AFDNP55196 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
AFDNP55196 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
AFDNP55196 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
AFDNP55196 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
AFDNP55196 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
AFDNP55196 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
AFDNP55196 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
AFDNP55196 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
AFDNP55196 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
AFDNP55196 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
AFDNP55196 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
AFDNP55196 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
AFDNP55196 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
AFDNP55196 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
AFDNP55196 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
AFDNP55196 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
AFDNP55196 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
AFDNP55196 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
AFDNP55196 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
AFDNP55196 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
AFDNP55196 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
AFDNP55196 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
AFDNP55196 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
AFDNP55196 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
AFDNP55196 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
AFDNP55196 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
AFDNP55196 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
AFDNP55196 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
AFDNP55196 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
AFDNP55196 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
AFDNP55196 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
AFDNP55196 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
AFDNP55196 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
AFDNP55196 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
AFDNP55196 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
AFDNP55196 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
AFDNP55196 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
AFDNP55196 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
AFDNP55196 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
AFDNP55196 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
AFDNP55196 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
AFDNP55196 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
AFDNP55196 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms