Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CLTCL1P53675 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CLTCL1P53675 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CLTCL1P53675 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CLTCL1P53675 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CLTCL1P53675 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CLTCL1P53675 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CLTCL1P53675 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CLTCL1P53675 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLTCL1P53675 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLTCL1P53675 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLTCL1P53675 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CLTCL1P53675 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CLTCL1P53675 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CLTCL1P53675 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
CLTCL1P53675 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CLTCL1P53675 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CLTCL1P53675 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CLTCL1P53675 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CLTCL1P53675 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CLTCL1P53675 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CLTCL1P53675 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CLTCL1P53675 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CLTCL1P53675 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLTCL1P53675 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLTCL1P53675 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CLTCL1P53675 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CLTCL1P53675 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CLTCL1P53675 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLTCL1P53675 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLTCL1P53675 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CLTCL1P53675 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CLTCL1P53675 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CLTCL1P53675 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CLTCL1P53675 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CLTCL1P53675 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
CLTCL1P53675 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CLTCL1P53675 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CLTCL1P53675 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CLTCL1P53675 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
CLTCL1P53675 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.7
CLTCL1P53675 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CLTCL1P53675 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CLTCL1P53675 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CLTCL1P53675 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CLTCL1P53675 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CLTCL1P53675 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CLTCL1P53675 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CLTCL1P53675 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CLTCL1P53675 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLTCL1P53675 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLTCL1P53675 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CLTCL1P53675 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLTCL1P53675 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLTCL1P53675 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLTCL1P53675 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CLTCL1P53675 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CLTCL1P53675 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CLTCL1P53675 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CLTCL1P53675 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CLTCL1P53675 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CLTCL1P53675 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CLTCL1P53675 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CLTCL1P53675 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CLTCL1P53675 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CLTCL1P53675 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CLTCL1P53675 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CLTCL1P53675 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CLTCL1P53675 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CLTCL1P53675 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CLTCL1P53675 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CLTCL1P53675 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms