Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB27AP51159 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB27AP51159 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB27AP51159 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB27AP51159 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB27AP51159 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB27AP51159 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB27AP51159 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB27AP51159 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB27AP51159 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB27AP51159 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB27AP51159 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB27AP51159 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB27AP51159 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB27AP51159 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB27AP51159 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAB27AP51159 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB27AP51159 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms