Protein–RNA interactions for Protein: P46989

ATG27, Autophagy-related protein 27, yeastyeast

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG27P46989 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG27P46989 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG27P46989 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG27P46989 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG27P46989 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG27P46989 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG27P46989 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG27P46989 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG27P46989 PRY1YJL079C 900 nt7.27□□□□□ -1.25
ATG27P46989 MIM1YOL026C 342 nt7.27□□□□□ -1.25
ATG27P46989 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.27□□□□□ -1.25
ATG27P46989 OSH7YHR001W 1314 nt7.27□□□□□ -1.25
ATG27P46989 RIM2YBR192W 1134 nt7.26□□□□□ -1.25
ATG27P46989 ENT4YLL038C 744 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG27P46989 DAK2YFL053W 1776 nt7.24□□□□□ -1.25
ATG27P46989 INH1YDL181W 258 nt7.24□□□□□ -1.25
ATG27P46989 RPC31YNL151C 756 nt7.24□□□□□ -1.25
ATG27P46989 TOK1YJL093C 2076 nt7.24□□□□□ -1.25
ATG27P46989 GND1YHR183W 1470 nt7.24□□□□□ -1.25
ATG27P46989 ITR2YOL103W 1830 nt7.23□□□□□ -1.25
ATG27P46989 CAB5YDR196C 726 nt7.23□□□□□ -1.25
ATG27P46989 RIB3YDR487C 627 nt7.23□□□□□ -1.25
ATG27P46989 NUC1YJL208C 990 nt7.23□□□□□ -1.25
ATG27P46989 HBS1YKR084C 1836 nt7.22□□□□□ -1.25
ATG27P46989 SMM1YNR015W 1155 nt7.22□□□□□ -1.25
ATG27P46989 DPL1YDR294C 1770 nt7.22□□□□□ -1.25
ATG27P46989 TAT2YOL020W 1779 nt7.22□□□□□ -1.25
ATG27P46989 SAM3YPL274W 1764 nt7.22□□□□□ -1.25
ATG27P46989 FET5YFL041W 1869 nt7.21□□□□□ -1.25
ATG27P46989 KRR1YCL059C 951 nt7.21□□□□□ -1.26
ATG27P46989 UFD1YGR048W 1086 nt7.21□□□□□ -1.26
ATG27P46989 VMA11YPL234C 495 nt7.21□□□□□ -1.26
ATG27P46989 LEU4YNL104C 1860 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG27P46989 LSM5YER146W 282 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG27P46989 TIP1YBR067C 633 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG27P46989 LSB5YCL034W 1065 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG27P46989 GLR1YPL091W 1452 nt7.19□□□□□ -1.26
ATG27P46989 SOL2YCR073W-A 948 nt7.19□□□□□ -1.26
ATG27P46989 YLR111WYLR111W 333 nt7.19□□□□□ -1.26
ATG27P46989 RAS2YNL098C 969 nt7.19□□□□□ -1.26
ATG27P46989 FIT1YDR534C 1587 nt7.18□□□□□ -1.26
ATG27P46989 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.18□□□□□ -1.26
ATG27P46989 GPN2YOR262W 1044 nt7.18□□□□□ -1.26
ATG27P46989 EAF3YPR023C 1206 nt7.17□□□□□ -1.26
ATG27P46989 DUR3YHL016C 2208 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG27P46989 LOT5YKL183W 921 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG27P46989 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG27P46989 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG27P46989 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG27P46989 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG27P46989 SNX3YOR357C 489 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG27P46989 RPT5YOR117W 1305 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG27P46989 NPP2YEL016C 1482 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG27P46989 OYE2YHR179W 1203 nt7.15□□□□□ -1.26
ATG27P46989 YJL118WYJL118W 660 nt7.15□□□□□ -1.26
ATG27P46989 YDR455CYDR455C 309 nt7.14□□□□□ -1.27
ATG27P46989 HXT12YIL170W 1374 nt7.14□□□□□ -1.27
ATG27P46989 YMR244WYMR244W 1068 nt7.13□□□□□ -1.27
ATG27P46989 YMR226CYMR226C 804 nt7.12□□□□□ -1.27
ATG27P46989 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.11□□□□□ -1.27
ATG27P46989 ORT1YOR130C 879 nt7.11□□□□□ -1.27
ATG27P46989 YPL041CYPL041C 624 nt7.11□□□□□ -1.27
ATG27P46989 DUS3YLR401C 2007 nt7.11□□□□□ -1.27
ATG27P46989 LPD1YFL018C 1500 nt7.11□□□□□ -1.27
ATG27P46989 TPS1YBR126C 1488 nt7.11□□□□□ -1.27
ATG27P46989 AAC3YBR085W 924 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG27P46989 TPN1YGL186C 1740 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG27P46989 CBK1YNL161W 2271 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG27P46989 MLS1YNL117W 1665 nt7.09□□□□□ -1.27
ATG27P46989 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.09□□□□□ -1.27
ATG27P46989 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.09□□□□□ -1.27
ATG27P46989 YJL055WYJL055W 738 nt7.09□□□□□ -1.27
ATG27P46989 TRP2YER090W 1524 nt7.09□□□□□ -1.27
ATG27P46989 YDR467CYDR467C 327 nt7.08□□□□□ -1.28
ATG27P46989 VRG4YGL225W 1014 nt7.08□□□□□ -1.28
ATG27P46989 SAC7YDR389W 1965 nt7.08□□□□□ -1.28
ATG27P46989 GAL3YDR009W 1563 nt7.08□□□□□ -1.28
ATG27P46989 POP2YNR052C 1302 nt7.07□□□□□ -1.28
ATG27P46989 ERG13YML126C 1476 nt7.07□□□□□ -1.28
ATG27P46989 TMA23YMR269W 636 nt7.07□□□□□ -1.28
ATG27P46989 RIB7YBR153W 735 nt7.07□□□□□ -1.28
ATG27P46989 snR4snR4 186 nt7.07□□□□□ -1.28
ATG27P46989 THI6YPL214C 1623 nt7.06□□□□□ -1.28
ATG27P46989 DDI1YER143W 1287 nt7.06□□□□□ -1.28
ATG27P46989 RRT8YOL048C 1029 nt7.06□□□□□ -1.28
ATG27P46989 HXT11YOL156W 1704 nt7.06□□□□□ -1.28
ATG27P46989 CSM2YIL132C 642 nt7.04□□□□□ -1.28
ATG27P46989 ADE16YLR028C 1776 nt7.04□□□□□ -1.28
ATG27P46989 YIL177CYIL177C 5277 nt7.03□□□□□ -1.28
ATG27P46989 YPI1YFR003C 468 nt7.03□□□□□ -1.28
ATG27P46989 IMO32YGR031W 1029 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG27P46989 MGM101YJR144W 810 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG27P46989 EMC3YKL207W 762 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG27P46989 RIB2YOL066C 1776 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG27P46989 SRM1YGL097W 1449 nt7.01□□□□□ -1.29
ATG27P46989 ALR1YOL130W 2580 nt7.01□□□□□ -1.29
ATG27P46989 YMR265CYMR265C 1386 nt7.01□□□□□ -1.29
ATG27P46989 TOM71YHR117W 1920 nt7.01□□□□□ -1.29
ATG27P46989 YNR064CYNR064C 873 nt6.98□□□□□ -1.29
ATG27P46989 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.3 ms