Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJC1P36383 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJC1P36383 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJC1P36383 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GJC1P36383 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJC1P36383 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJC1P36383 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GJC1P36383 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJC1P36383 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJC1P36383 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJC1P36383 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJC1P36383 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJC1P36383 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GJC1P36383 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJC1P36383 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJC1P36383 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJC1P36383 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJC1P36383 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJC1P36383 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJC1P36383 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJC1P36383 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GJC1P36383 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJC1P36383 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJC1P36383 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJC1P36383 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJC1P36383 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJC1P36383 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJC1P36383 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJC1P36383 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJC1P36383 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJC1P36383 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJC1P36383 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJC1P36383 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJC1P36383 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJC1P36383 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJC1P36383 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJC1P36383 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJC1P36383 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJC1P36383 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJC1P36383 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJC1P36383 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJC1P36383 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJC1P36383 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJC1P36383 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJC1P36383 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJC1P36383 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJC1P36383 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJC1P36383 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJC1P36383 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJC1P36383 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJC1P36383 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJC1P36383 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJC1P36383 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJC1P36383 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJC1P36383 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJC1P36383 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJC1P36383 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJC1P36383 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJC1P36383 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJC1P36383 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJC1P36383 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJC1P36383 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJC1P36383 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJC1P36383 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJC1P36383 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJC1P36383 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJC1P36383 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJC1P36383 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJC1P36383 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJC1P36383 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJC1P36383 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJC1P36383 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJC1P36383 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJC1P36383 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJC1P36383 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJC1P36383 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJC1P36383 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJC1P36383 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJC1P36383 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJC1P36383 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GJC1P36383 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJC1P36383 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GJC1P36383 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GJC1P36383 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJC1P36383 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJC1P36383 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJC1P36383 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJC1P36383 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJC1P36383 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJC1P36383 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJC1P36383 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJC1P36383 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJC1P36383 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJC1P36383 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJC1P36383 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJC1P36383 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJC1P36383 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJC1P36383 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJC1P36383 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJC1P36383 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms