Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP1P28562 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUSP1P28562 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP1P28562 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP1P28562 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms