Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 TRAK1-205ENST00000427771 900 ntTSL 321.35■■□□□ 1.013e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.693e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.633e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.633e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 IPO4-220ENST00000561462 1864 ntTSL 218.91■□□□□ 0.623e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.413e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 THTPA-205ENST00000555446 571 ntTSL 216.68■□□□□ 0.263e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.083e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 IPO4-214ENST00000560798 3581 ntTSL 214.44□□□□□ -0.13e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 IPO4-207ENST00000558780 3540 ntTSL 214.32□□□□□ -0.123e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 TRAK1-206ENST00000449246 3260 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.133e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 IPO4-203ENST00000558046 3440 ntTSL 214.11□□□□□ -0.153e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 IPO4-218ENST00000561199 3249 ntTSL 213.86□□□□□ -0.193e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 EXOSC9-202ENST00000379663 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.193e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 AL136295.4-201ENST00000561419 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.23e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 TRAK1-202ENST00000341421 4620 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 IPO4-211ENST00000560155 3485 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.263e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 IPO4-209ENST00000559588 3537 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.273e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 IPO4-217ENST00000561090 3632 ntTSL 213.15□□□□□ -0.33e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 IPO4-201ENST00000354464 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.33e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 TTPAL-201ENST00000262605 6212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.573e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 EXOSC9-208ENST00000509980 1317 ntTSL 211.35□□□□□ -0.593e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 TTPAL-202ENST00000372904 6234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.633e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 EXOSC9-201ENST00000243498 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.743e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 THTPA-207ENST00000556545 339 ntTSL 210.33□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 EXOSC9-211ENST00000512454 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.813e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 ARSB-205ENST00000521800 1082 ntTSL 29.05□□□□□ -0.963e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 TTPAL-204ENST00000456317 926 ntTSL 28.62□□□□□ -1.033e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 EXOSC9-212ENST00000513654 3882 ntTSL 27.97□□□□□ -1.133e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 EXOSC9-203ENST00000503139 1204 ntTSL 1 (best)7.22□□□□□ -1.253e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 GFM2-210ENST00000515125 1125 ntTSL 37.04□□□□□ -1.283e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 EXOSC9-209ENST00000511132 515 ntTSL 56.24□□□□□ -1.413e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 GFM2-209ENST00000514734 907 ntTSL 55.96□□□□□ -1.463e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 EXOSC9-206ENST00000508212 612 ntTSL 34.1□□□□□ -1.753e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 EXOSC9-204ENST00000503236 644 ntTSL 33.9□□□□□ -1.793e-10■■■■■ 44.2
U2AF2P26368 ACAP2-206ENST00000450200 684 ntTSL 59.42□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 44.1
U2AF2P26368 UTP4-212ENST00000567500 737 ntTSL 56.26□□□□□ -1.412e-9■■■■■ 44.1
U2AF2P26368 TUBE1-210ENST00000604967 582 ntTSL 511.96□□□□□ -0.491e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.382e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.362e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.322e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.082e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.662e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-214ENST00000452216 913 ntTSL 1 (best)19.18■□□□□ 0.662e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-209ENST00000436782 1683 ntTSL 1 (best)18.14■□□□□ 0.492e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-213ENST00000451338 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.16■□□□□ 0.342e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-207ENST00000423763 1792 ntTSL 216.87■□□□□ 0.292e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.252e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-212ENST00000447501 1249 ntTSL 216.06■□□□□ 0.162e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-211ENST00000438133 1771 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.022e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-219ENST00000531229 737 ntTSL 215.13■□□□□ 0.012e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-13■■■■■ 44
U2AF2P26368 TTTY15-203ENST00000457658 630 ntTSL 214.63□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 44
U2AF2P26368 TTTY15-201ENST00000417071 882 ntTSL 29.37□□□□□ -0.911e-8■■■■■ 44
U2AF2P26368 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.061e-8■■■■■ 44
U2AF2P26368 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.032e-10■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-10■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 CEP83-207ENST00000547232 2166 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.172e-10■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 CEP83-209ENST00000549352 861 ntTSL 1 (best)4.95□□□□□ -1.622e-10■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.912e-10■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 CEP83-210ENST00000550328 241 ntTSL 51.27□□□□□ -2.212e-10■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 HAL-206ENST00000546999 2271 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.336e-8■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 HAL-204ENST00000544080 2804 ntTSL 216.49■□□□□ 0.236e-8■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 HAL-201ENST00000261208 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.546e-8■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 HAL-203ENST00000541929 3846 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.576e-8■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 N4BP2L2-212ENST00000505213 2343 ntTSL 512.1□□□□□ -0.472e-16■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 N4BP2L2-214ENST00000511143 816 ntTSL 38.59□□□□□ -1.032e-16■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 N4BP2L2-210ENST00000503814 5317 ntTSL 1 (best)8.03□□□□□ -1.122e-16■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.312e-16■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 N4BP2L2-213ENST00000509076 3060 ntTSL 55.92□□□□□ -1.462e-16■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 N4BP2L2-207ENST00000475731 444 ntTSL 54.8□□□□□ -1.642e-16■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.662e-16■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.732e-16■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.922e-16■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.932e-16■■■■■ 43.9
U2AF2P26368 FMO5-204ENST00000478432 1606 ntTSL 210.33□□□□□ -0.769e-12■■■■■ 43.8
U2AF2P26368 INPP4A-209ENST00000498026 499 ntTSL 313.25□□□□□ -0.293e-26■■■■■ 43.7
U2AF2P26368 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.193e-9■■■■■ 43.7
U2AF2P26368 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.63e-9■■■■■ 43.7
U2AF2P26368 PPARGC1A-216ENST00000612355 936 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.74e-11■■■■■ 43.4
U2AF2P26368 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.592e-12■■■■■ 43.3
U2AF2P26368 RNF149-202ENST00000424632 2010 ntTSL 223.53■■□□□ 1.362e-12■■■■■ 43.3
U2AF2P26368 RNF149-206ENST00000490553 592 ntTSL 47.43□□□□□ -1.222e-12■■■■■ 43.3
U2AF2P26368 RNF149-203ENST00000463726 622 ntTSL 43.02□□□□□ -1.932e-12■■■■■ 43.3
U2AF2P26368 MTMR3-212ENST00000495098 461 ntTSL 424.12■■□□□ 1.452e-13■■■■■ 43.3
U2AF2P26368 MTMR3-207ENST00000445401 665 ntTSL 316.94■□□□□ 0.32e-13■■■■■ 43.3
U2AF2P26368 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.052e-13■■■■■ 43.3
U2AF2P26368 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-13■■■■■ 43.3
U2AF2P26368 MTMR3-203ENST00000351488 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.342e-13■■■■■ 43.3
U2AF2P26368 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-13■■■■■ 43.3
U2AF2P26368 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.822e-13■■■■■ 43.3
U2AF2P26368 MTMR3-206ENST00000415511 604 ntTSL 37.3□□□□□ -1.242e-13■■■■■ 43.3
U2AF2P26368 DCTN2-208ENST00000547480 599 ntTSL 218.15■□□□□ 0.53e-10■■■■■ 43
U2AF2P26368 DCTN2-221ENST00000551400 568 ntTSL 314.65□□□□□ -0.063e-10■■■■■ 43
U2AF2P26368 DCTN2-207ENST00000547345 566 ntTSL 27.94□□□□□ -1.143e-10■■■■■ 43
U2AF2P26368 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 524.86■■□□□ 1.575e-10■■■■■ 42.9
U2AF2P26368 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 520.68■□□□□ 0.95e-10■■■■■ 42.9
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