RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.01■■■■□ 3.04
TTPAL-203ENST00000372906 ABCC9O60706 1549 aa30.93■■■□□ 2.54
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.55■■■□□ 2.48
TTPAL-203ENST00000372906 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.34■■■□□ 2.29
TTPAL-203ENST00000372906 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.22■■■□□ 2.27
TTPAL-203ENST00000372906 NACADO15069 1562 aa28.96■■■□□ 2.23
TTPAL-203ENST00000372906 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.94■■■□□ 2.22
TTPAL-203ENST00000372906 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.2
TTPAL-203ENST00000372906 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.66■■■□□ 2.18
TTPAL-203ENST00000372906 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.47■■■□□ 2.15
TTPAL-203ENST00000372906 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.43■■■□□ 2.14
TTPAL-203ENST00000372906 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TTPAL-203ENST00000372906 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28■■■□□ 2.07
TTPAL-203ENST00000372906 SCRIBQ14160 1630 aa27.92■■■□□ 2.06
TTPAL-203ENST00000372906 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.89■■■□□ 2.06
TTPAL-203ENST00000372906 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.88■■■□□ 2.05
TTPAL-203ENST00000372906 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.84■■■□□ 2.05
TTPAL-203ENST00000372906 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
TTPAL-203ENST00000372906 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.03■■□□□ 1.92
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TTPAL-203ENST00000372906 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.68■■□□□ 1.86
TTPAL-203ENST00000372906 ERCC6Q03468 1493 aa26.66■■□□□ 1.86
TTPAL-203ENST00000372906 CUX2O14529 1486 aa26.65■■□□□ 1.86
TTPAL-203ENST00000372906 SMARCA4P51532 1647 aa26.57■■□□□ 1.84
TTPAL-203ENST00000372906 SMARCA2P51531 1590 aa26.53■■□□□ 1.84
TTPAL-203ENST00000372906 NESP48681 1621 aa26.53■■□□□ 1.84
TTPAL-203ENST00000372906 HMGXB3Q12766 1538 aa26.51■■□□□ 1.83
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TTPAL-203ENST00000372906 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.25■■□□□ 1.79
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TTPAL-203ENST00000372906 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.18■■□□□ 1.78
TTPAL-203ENST00000372906 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.12■■□□□ 1.77
TTPAL-203ENST00000372906 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.05■■□□□ 1.76
TTPAL-203ENST00000372906 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.96■■□□□ 1.75
TTPAL-203ENST00000372906 WIZO95785 1651 aa25.93■■□□□ 1.74
TTPAL-203ENST00000372906 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.85■■□□□ 1.73
TTPAL-203ENST00000372906 WDR62O43379 1518 aa25.78■■□□□ 1.72
TTPAL-203ENST00000372906 TRIM41Q8WV44 630 aa25.78■■□□□ 1.72
TTPAL-203ENST00000372906 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.69■■□□□ 1.7
TTPAL-203ENST00000372906 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.67■■□□□ 1.7
TTPAL-203ENST00000372906 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TTPAL-203ENST00000372906 CFTRP13569 1480 aa25.6■■□□□ 1.69
TTPAL-203ENST00000372906 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
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TTPAL-203ENST00000372906 OSCARQ8IYS5 282 aa25.47■■□□□ 1.67
TTPAL-203ENST00000372906 PRDM2Q13029 1718 aa25.29■■□□□ 1.64
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.29■■□□□ 1.64
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TTPAL-203ENST00000372906 IFT140Q96RY7 1462 aa25.18■■□□□ 1.62
TTPAL-203ENST00000372906 TOPBP1Q92547 1522 aa25.17■■□□□ 1.62
TTPAL-203ENST00000372906 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.16■■□□□ 1.62
TTPAL-203ENST00000372906 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.16■■□□□ 1.62
TTPAL-203ENST00000372906 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.16■■□□□ 1.62
TTPAL-203ENST00000372906 ARHGEF11O15085 1522 aa25.04■■□□□ 1.6
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TTPAL-203ENST00000372906 ABCC8Q09428 1581 aa25.01■■□□□ 1.59
TTPAL-203ENST00000372906 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.01■■□□□ 1.59
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TTPAL-203ENST00000372906 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.95■■□□□ 1.58
TTPAL-203ENST00000372906 CHD1O14646 1710 aa24.93■■□□□ 1.58
TTPAL-203ENST00000372906 FBLN2P98095 1184 aa24.9■■□□□ 1.58
TTPAL-203ENST00000372906 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
TTPAL-203ENST00000372906 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.87■■□□□ 1.57
TTPAL-203ENST00000372906 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TTPAL-203ENST00000372906 ARAP1Q96P48 1450 aa24.8■■□□□ 1.56
TTPAL-203ENST00000372906 SOGA1O94964 1423 aa24.79■■□□□ 1.56
TTPAL-203ENST00000372906 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TTPAL-203ENST00000372906 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.7■■□□□ 1.55
TTPAL-203ENST00000372906 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.69■■□□□ 1.54
TTPAL-203ENST00000372906 CUX1P39880 1505 aa24.66■■□□□ 1.54
TTPAL-203ENST00000372906 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TTPAL-203ENST00000372906 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.61■■□□□ 1.53
TTPAL-203ENST00000372906 WDR97A6NE52 1622 aa24.57■■□□□ 1.52
TTPAL-203ENST00000372906 GRIN2BQ13224 1484 aa24.56■■□□□ 1.52
TTPAL-203ENST00000372906 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
TTPAL-203ENST00000372906 SYNJ1O43426 1573 aa24.54■■□□□ 1.52
TTPAL-203ENST00000372906 SYNJ2O15056 1496 aa24.51■■□□□ 1.51
TTPAL-203ENST00000372906 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.46■■□□□ 1.51
TTPAL-203ENST00000372906 PBRM1Q86U86 1689 aa24.46■■□□□ 1.51
TTPAL-203ENST00000372906 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.38■■□□□ 1.49
TTPAL-203ENST00000372906 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.37■■□□□ 1.49
TTPAL-203ENST00000372906 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TTPAL-203ENST00000372906 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.3■■□□□ 1.48
TTPAL-203ENST00000372906 GRIN2AQ12879 1464 aa24.26■■□□□ 1.47
TTPAL-203ENST00000372906 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
TTPAL-203ENST00000372906 CEP170Q5SW79 1584 aa24.21■■□□□ 1.47
TTPAL-203ENST00000372906 ADAMTS12P58397 1594 aa24.2■■□□□ 1.46
TTPAL-203ENST00000372906 NUP160Q12769 1436 aa24.18■■□□□ 1.46
TTPAL-203ENST00000372906 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TTPAL-203ENST00000372906 TOP2BQ02880 1626 aa24.15■■□□□ 1.46
TTPAL-203ENST00000372906 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.15■■□□□ 1.46
TTPAL-203ENST00000372906 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.12■■□□□ 1.45
TTPAL-203ENST00000372906 SHROOM2Q13796 1616 aa24.1■■□□□ 1.45
TTPAL-203ENST00000372906 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.05■■□□□ 1.44
TTPAL-203ENST00000372906 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
TTPAL-203ENST00000372906 JPH4Q96JJ6 628 aa24■■□□□ 1.43
TTPAL-203ENST00000372906 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.95■■□□□ 1.42
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