RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456317.1

TTPAL-204, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 2

Gene TTPAL, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-204ENST00000456317 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TTPAL-204ENST00000456317 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.61■■□□□ 1.21
TTPAL-204ENST00000456317 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.28■□□□□ 0.84
TTPAL-204ENST00000456317 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
TTPAL-204ENST00000456317 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
TTPAL-204ENST00000456317 ABCC9O60706 1549 aa19.48■□□□□ 0.71
TTPAL-204ENST00000456317 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.98■□□□□ 0.63
TTPAL-204ENST00000456317 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.56■□□□□ 0.56
TTPAL-204ENST00000456317 FOXD1Q16676 465 aa18.53■□□□□ 0.56
TTPAL-204ENST00000456317 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.21■□□□□ 0.51
TTPAL-204ENST00000456317 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.15■□□□□ 0.5
TTPAL-204ENST00000456317 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.11■□□□□ 0.49
TTPAL-204ENST00000456317 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
TTPAL-204ENST00000456317 NACADO15069 1562 aa17.78■□□□□ 0.44
TTPAL-204ENST00000456317 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.7■□□□□ 0.42
TTPAL-204ENST00000456317 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.7■□□□□ 0.42
TTPAL-204ENST00000456317 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.68■□□□□ 0.42
TTPAL-204ENST00000456317 ADRA2BP18089 450 aa17.65■□□□□ 0.42
TTPAL-204ENST00000456317 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.63■□□□□ 0.41
TTPAL-204ENST00000456317 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.56■□□□□ 0.4
TTPAL-204ENST00000456317 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.52■□□□□ 0.4
TTPAL-204ENST00000456317 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TTPAL-204ENST00000456317 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.26■□□□□ 0.35
TTPAL-204ENST00000456317 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
TTPAL-204ENST00000456317 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.19■□□□□ 0.34
TTPAL-204ENST00000456317 CUX2O14529 1486 aa17.12■□□□□ 0.33
TTPAL-204ENST00000456317 TRIM41Q8WV44 630 aa17.08■□□□□ 0.32
TTPAL-204ENST00000456317 MSH5O43196 834 aa17.06■□□□□ 0.32
TTPAL-204ENST00000456317 ERCC6Q03468 1493 aa16.95■□□□□ 0.3
TTPAL-204ENST00000456317 SCRIBQ14160 1630 aa16.92■□□□□ 0.3
TTPAL-204ENST00000456317 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.65■□□□□ 0.26
TTPAL-204ENST00000456317 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TTPAL-204ENST00000456317 NESP48681 1621 aa16.45■□□□□ 0.22
TTPAL-204ENST00000456317 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TTPAL-204ENST00000456317 NCAPD3P42695 1498 aa16.4■□□□□ 0.22
TTPAL-204ENST00000456317 SMARCA2P51531 1590 aa16.34■□□□□ 0.21
TTPAL-204ENST00000456317 OSCARQ8IYS5 282 aa16.27■□□□□ 0.2
TTPAL-204ENST00000456317 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.24■□□□□ 0.19
TTPAL-204ENST00000456317 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TTPAL-204ENST00000456317 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.21■□□□□ 0.19
TTPAL-204ENST00000456317 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.21■□□□□ 0.18
TTPAL-204ENST00000456317 HMGXB3Q12766 1538 aa16.2■□□□□ 0.18
TTPAL-204ENST00000456317 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.19■□□□□ 0.18
TTPAL-204ENST00000456317 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TTPAL-204ENST00000456317 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TTPAL-204ENST00000456317 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TTPAL-204ENST00000456317 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.09■□□□□ 0.17
TTPAL-204ENST00000456317 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.09■□□□□ 0.17
TTPAL-204ENST00000456317 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.09■□□□□ 0.17
TTPAL-204ENST00000456317 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.07■□□□□ 0.16
TTPAL-204ENST00000456317 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.06■□□□□ 0.16
TTPAL-204ENST00000456317 POTEDQ86YR6 584 aa16.06■□□□□ 0.16
TTPAL-204ENST00000456317 SMARCA4P51532 1647 aa16.01■□□□□ 0.15
TTPAL-204ENST00000456317 WDR62O43379 1518 aa16.01■□□□□ 0.15
TTPAL-204ENST00000456317 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TTPAL-204ENST00000456317 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.96■□□□□ 0.15
TTPAL-204ENST00000456317 ARHGEF11O15085 1522 aa15.94■□□□□ 0.14
TTPAL-204ENST00000456317 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.91■□□□□ 0.14
TTPAL-204ENST00000456317 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.85■□□□□ 0.13
TTPAL-204ENST00000456317 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.82■□□□□ 0.12
TTPAL-204ENST00000456317 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.8■□□□□ 0.12
TTPAL-204ENST00000456317 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.73■□□□□ 0.11
TTPAL-204ENST00000456317 ARAP1Q96P48 1450 aa15.71■□□□□ 0.11
TTPAL-204ENST00000456317 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
TTPAL-204ENST00000456317 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TTPAL-204ENST00000456317 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.62■□□□□ 0.09
TTPAL-204ENST00000456317 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.62■□□□□ 0.09
TTPAL-204ENST00000456317 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
TTPAL-204ENST00000456317 FBLN2P98095 1184 aa15.57■□□□□ 0.08
TTPAL-204ENST00000456317 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TTPAL-204ENST00000456317 IFT140Q96RY7 1462 aa15.56■□□□□ 0.08
TTPAL-204ENST00000456317 CHD1O14646 1710 aa15.53■□□□□ 0.08
TTPAL-204ENST00000456317 CFTRP13569 1480 aa15.51■□□□□ 0.07
TTPAL-204ENST00000456317 KCNA4P22459 653 aa15.48■□□□□ 0.07
TTPAL-204ENST00000456317 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TTPAL-204ENST00000456317 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TTPAL-204ENST00000456317 WIZO95785 1651 aa15.41■□□□□ 0.06
TTPAL-204ENST00000456317 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
TTPAL-204ENST00000456317 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TTPAL-204ENST00000456317 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TTPAL-204ENST00000456317 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
TTPAL-204ENST00000456317 TOPBP1Q92547 1522 aa15.32■□□□□ 0.04
TTPAL-204ENST00000456317 PRDM2Q13029 1718 aa15.3■□□□□ 0.04
TTPAL-204ENST00000456317 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TTPAL-204ENST00000456317 SYNJ1O43426 1573 aa15.28■□□□□ 0.04
TTPAL-204ENST00000456317 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.27■□□□□ 0.04
TTPAL-204ENST00000456317 ABCC8Q09428 1581 aa15.27■□□□□ 0.03
TTPAL-204ENST00000456317 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.25■□□□□ 0.03
TTPAL-204ENST00000456317 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.21■□□□□ 0.03
TTPAL-204ENST00000456317 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
TTPAL-204ENST00000456317 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.19■□□□□ 0.02
TTPAL-204ENST00000456317 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.19■□□□□ 0.02
TTPAL-204ENST00000456317 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.17■□□□□ 0.02
TTPAL-204ENST00000456317 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTPAL-204ENST00000456317 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTPAL-204ENST00000456317 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
TTPAL-204ENST00000456317 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.1■□□□□ 0.01
TTPAL-204ENST00000456317 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
TTPAL-204ENST00000456317 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.09■□□□□ 0.01
TTPAL-204ENST00000456317 SOGA1O94964 1423 aa15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.2 ms