Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP3P21580 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP3P21580 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFAIP3P21580 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP3P21580 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNFAIP3P21580 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms