Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM6P0DI80 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM6P0DI80 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM6P0DI80 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms