Protein–RNA interactions for Protein: P07996

THBS1, Thrombospondin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1P07996 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THBS1P07996 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THBS1P07996 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
THBS1P07996 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THBS1P07996 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THBS1P07996 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THBS1P07996 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THBS1P07996 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THBS1P07996 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THBS1P07996 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THBS1P07996 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THBS1P07996 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THBS1P07996 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THBS1P07996 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THBS1P07996 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THBS1P07996 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THBS1P07996 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THBS1P07996 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THBS1P07996 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THBS1P07996 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THBS1P07996 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THBS1P07996 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THBS1P07996 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THBS1P07996 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS1P07996 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS1P07996 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS1P07996 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS1P07996 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS1P07996 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THBS1P07996 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THBS1P07996 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THBS1P07996 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THBS1P07996 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THBS1P07996 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THBS1P07996 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THBS1P07996 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THBS1P07996 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
THBS1P07996 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
THBS1P07996 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THBS1P07996 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THBS1P07996 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THBS1P07996 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THBS1P07996 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THBS1P07996 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THBS1P07996 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THBS1P07996 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THBS1P07996 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THBS1P07996 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THBS1P07996 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THBS1P07996 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THBS1P07996 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THBS1P07996 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THBS1P07996 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THBS1P07996 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THBS1P07996 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THBS1P07996 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THBS1P07996 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THBS1P07996 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THBS1P07996 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THBS1P07996 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THBS1P07996 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THBS1P07996 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THBS1P07996 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THBS1P07996 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THBS1P07996 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THBS1P07996 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THBS1P07996 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THBS1P07996 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
THBS1P07996 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THBS1P07996 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THBS1P07996 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
THBS1P07996 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THBS1P07996 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THBS1P07996 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THBS1P07996 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THBS1P07996 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THBS1P07996 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THBS1P07996 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THBS1P07996 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THBS1P07996 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THBS1P07996 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THBS1P07996 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THBS1P07996 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THBS1P07996 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THBS1P07996 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THBS1P07996 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THBS1P07996 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THBS1P07996 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THBS1P07996 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THBS1P07996 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THBS1P07996 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THBS1P07996 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
THBS1P07996 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
THBS1P07996 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THBS1P07996 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THBS1P07996 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THBS1P07996 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THBS1P07996 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THBS1P07996 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THBS1P07996 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms