Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F13BP05160 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F13BP05160 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F13BP05160 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
F13BP05160 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F13BP05160 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F13BP05160 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F13BP05160 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F13BP05160 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F13BP05160 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
F13BP05160 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F13BP05160 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F13BP05160 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F13BP05160 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F13BP05160 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F13BP05160 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F13BP05160 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F13BP05160 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
F13BP05160 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
F13BP05160 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F13BP05160 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F13BP05160 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F13BP05160 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F13BP05160 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F13BP05160 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F13BP05160 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F13BP05160 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F13BP05160 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F13BP05160 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F13BP05160 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F13BP05160 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F13BP05160 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F13BP05160 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F13BP05160 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F13BP05160 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F13BP05160 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
F13BP05160 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F13BP05160 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F13BP05160 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
F13BP05160 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F13BP05160 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F13BP05160 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F13BP05160 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F13BP05160 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13BP05160 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13BP05160 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13BP05160 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13BP05160 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13BP05160 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13BP05160 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13BP05160 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13BP05160 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13BP05160 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F13BP05160 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F13BP05160 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13BP05160 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13BP05160 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13BP05160 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13BP05160 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13BP05160 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13BP05160 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13BP05160 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13BP05160 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
F13BP05160 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13BP05160 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13BP05160 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13BP05160 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
F13BP05160 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13BP05160 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13BP05160 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13BP05160 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13BP05160 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13BP05160 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13BP05160 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13BP05160 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13BP05160 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13BP05160 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13BP05160 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13BP05160 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F13BP05160 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13BP05160 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13BP05160 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13BP05160 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13BP05160 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13BP05160 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13BP05160 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13BP05160 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F13BP05160 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F13BP05160 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F13BP05160 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F13BP05160 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F13BP05160 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F13BP05160 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F13BP05160 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F13BP05160 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F13BP05160 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F13BP05160 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F13BP05160 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F13BP05160 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F13BP05160 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms