Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMG1P04279 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMG1P04279 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMG1P04279 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMG1P04279 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMG1P04279 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMG1P04279 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMG1P04279 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMG1P04279 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMG1P04279 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMG1P04279 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMG1P04279 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMG1P04279 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMG1P04279 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMG1P04279 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMG1P04279 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1145.8 ms