Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGHA1P01876 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHA1P01876 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHA1P01876 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHA1P01876 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGHA1P01876 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHA1P01876 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms