Protein–RNA interactions for Protein: O95970

LGI1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI1O95970 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGI1O95970 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGI1O95970 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGI1O95970 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGI1O95970 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGI1O95970 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LGI1O95970 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGI1O95970 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGI1O95970 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGI1O95970 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LGI1O95970 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGI1O95970 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGI1O95970 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGI1O95970 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGI1O95970 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGI1O95970 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGI1O95970 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGI1O95970 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGI1O95970 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGI1O95970 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGI1O95970 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGI1O95970 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGI1O95970 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGI1O95970 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGI1O95970 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGI1O95970 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGI1O95970 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGI1O95970 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGI1O95970 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGI1O95970 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGI1O95970 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LGI1O95970 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LGI1O95970 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LGI1O95970 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGI1O95970 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGI1O95970 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGI1O95970 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGI1O95970 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGI1O95970 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGI1O95970 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGI1O95970 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGI1O95970 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGI1O95970 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LGI1O95970 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGI1O95970 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGI1O95970 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGI1O95970 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LGI1O95970 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGI1O95970 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGI1O95970 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGI1O95970 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGI1O95970 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGI1O95970 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGI1O95970 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGI1O95970 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LGI1O95970 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGI1O95970 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGI1O95970 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGI1O95970 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGI1O95970 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGI1O95970 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGI1O95970 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGI1O95970 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGI1O95970 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGI1O95970 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGI1O95970 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LGI1O95970 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGI1O95970 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGI1O95970 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGI1O95970 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGI1O95970 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGI1O95970 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGI1O95970 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGI1O95970 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LGI1O95970 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGI1O95970 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGI1O95970 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LGI1O95970 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LGI1O95970 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGI1O95970 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGI1O95970 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGI1O95970 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGI1O95970 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGI1O95970 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGI1O95970 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGI1O95970 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGI1O95970 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGI1O95970 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGI1O95970 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGI1O95970 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGI1O95970 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGI1O95970 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGI1O95970 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGI1O95970 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGI1O95970 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGI1O95970 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGI1O95970 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGI1O95970 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGI1O95970 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGI1O95970 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms