Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOL3O95236 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOL3O95236 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOL3O95236 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOL3O95236 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOL3O95236 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOL3O95236 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOL3O95236 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOL3O95236 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOL3O95236 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOL3O95236 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOL3O95236 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APOL3O95236 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APOL3O95236 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOL3O95236 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOL3O95236 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOL3O95236 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOL3O95236 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOL3O95236 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOL3O95236 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL3O95236 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL3O95236 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL3O95236 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL3O95236 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL3O95236 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL3O95236 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOL3O95236 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOL3O95236 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOL3O95236 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOL3O95236 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOL3O95236 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOL3O95236 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOL3O95236 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOL3O95236 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOL3O95236 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOL3O95236 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOL3O95236 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOL3O95236 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOL3O95236 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOL3O95236 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOL3O95236 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOL3O95236 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOL3O95236 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOL3O95236 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOL3O95236 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOL3O95236 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOL3O95236 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOL3O95236 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOL3O95236 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOL3O95236 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOL3O95236 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOL3O95236 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOL3O95236 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOL3O95236 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOL3O95236 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOL3O95236 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOL3O95236 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOL3O95236 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOL3O95236 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOL3O95236 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOL3O95236 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOL3O95236 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOL3O95236 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOL3O95236 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APOL3O95236 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOL3O95236 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOL3O95236 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOL3O95236 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOL3O95236 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOL3O95236 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOL3O95236 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOL3O95236 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOL3O95236 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOL3O95236 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOL3O95236 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOL3O95236 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOL3O95236 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOL3O95236 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOL3O95236 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOL3O95236 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOL3O95236 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOL3O95236 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
APOL3O95236 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOL3O95236 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOL3O95236 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOL3O95236 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOL3O95236 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOL3O95236 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOL3O95236 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOL3O95236 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL3O95236 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL3O95236 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL3O95236 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL3O95236 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL3O95236 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL3O95236 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL3O95236 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL3O95236 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL3O95236 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL3O95236 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms