Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCM2O75603 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GCM2O75603 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCM2O75603 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCM2O75603 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCM2O75603 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCM2O75603 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCM2O75603 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCM2O75603 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCM2O75603 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCM2O75603 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCM2O75603 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCM2O75603 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCM2O75603 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCM2O75603 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCM2O75603 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCM2O75603 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCM2O75603 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCM2O75603 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCM2O75603 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCM2O75603 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCM2O75603 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GCM2O75603 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCM2O75603 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCM2O75603 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCM2O75603 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCM2O75603 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCM2O75603 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCM2O75603 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCM2O75603 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCM2O75603 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCM2O75603 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCM2O75603 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCM2O75603 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCM2O75603 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCM2O75603 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GCM2O75603 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCM2O75603 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCM2O75603 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCM2O75603 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCM2O75603 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCM2O75603 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCM2O75603 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCM2O75603 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCM2O75603 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCM2O75603 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCM2O75603 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCM2O75603 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCM2O75603 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCM2O75603 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCM2O75603 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCM2O75603 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCM2O75603 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GCM2O75603 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCM2O75603 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCM2O75603 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCM2O75603 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCM2O75603 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCM2O75603 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCM2O75603 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCM2O75603 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCM2O75603 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCM2O75603 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCM2O75603 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCM2O75603 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCM2O75603 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCM2O75603 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCM2O75603 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GCM2O75603 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCM2O75603 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCM2O75603 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCM2O75603 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCM2O75603 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCM2O75603 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCM2O75603 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCM2O75603 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCM2O75603 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCM2O75603 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCM2O75603 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCM2O75603 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCM2O75603 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCM2O75603 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCM2O75603 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GCM2O75603 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCM2O75603 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCM2O75603 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCM2O75603 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCM2O75603 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCM2O75603 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCM2O75603 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCM2O75603 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCM2O75603 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCM2O75603 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCM2O75603 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCM2O75603 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCM2O75603 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCM2O75603 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCM2O75603 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GCM2O75603 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCM2O75603 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms