Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KERAO60938 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KERAO60938 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KERAO60938 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KERAO60938 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KERAO60938 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KERAO60938 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KERAO60938 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KERAO60938 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KERAO60938 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KERAO60938 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KERAO60938 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KERAO60938 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KERAO60938 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KERAO60938 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KERAO60938 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KERAO60938 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KERAO60938 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KERAO60938 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KERAO60938 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KERAO60938 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KERAO60938 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KERAO60938 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KERAO60938 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KERAO60938 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KERAO60938 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KERAO60938 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KERAO60938 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KERAO60938 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KERAO60938 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KERAO60938 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KERAO60938 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KERAO60938 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KERAO60938 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KERAO60938 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KERAO60938 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KERAO60938 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KERAO60938 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KERAO60938 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KERAO60938 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KERAO60938 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KERAO60938 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KERAO60938 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KERAO60938 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KERAO60938 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KERAO60938 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KERAO60938 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KERAO60938 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KERAO60938 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KERAO60938 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KERAO60938 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KERAO60938 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KERAO60938 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KERAO60938 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KERAO60938 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KERAO60938 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KERAO60938 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KERAO60938 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KERAO60938 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KERAO60938 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KERAO60938 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KERAO60938 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KERAO60938 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KERAO60938 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KERAO60938 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KERAO60938 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KERAO60938 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KERAO60938 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KERAO60938 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KERAO60938 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KERAO60938 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KERAO60938 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KERAO60938 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KERAO60938 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KERAO60938 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KERAO60938 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KERAO60938 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KERAO60938 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KERAO60938 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KERAO60938 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KERAO60938 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KERAO60938 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KERAO60938 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KERAO60938 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KERAO60938 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KERAO60938 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KERAO60938 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KERAO60938 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KERAO60938 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KERAO60938 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KERAO60938 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KERAO60938 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KERAO60938 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KERAO60938 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KERAO60938 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KERAO60938 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KERAO60938 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KERAO60938 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KERAO60938 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KERAO60938 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms