Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEC16AO15027 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC16AO15027 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC16AO15027 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC16AO15027 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC16AO15027 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC16AO15027 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC16AO15027 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC16AO15027 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC16AO15027 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC16AO15027 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC16AO15027 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC16AO15027 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC16AO15027 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC16AO15027 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC16AO15027 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC16AO15027 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms