Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP17L13C9JLJ4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP17L13C9JLJ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L13C9JLJ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP17L13C9JLJ4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP17L13C9JLJ4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP17L13C9JLJ4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP17L13C9JLJ4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP17L13C9JLJ4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP17L13C9JLJ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP17L13C9JLJ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
USP17L13C9JLJ4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP17L13C9JLJ4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP17L13C9JLJ4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP17L13C9JLJ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP17L13C9JLJ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP17L13C9JLJ4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP17L13C9JLJ4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP17L13C9JLJ4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP17L13C9JLJ4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP17L13C9JLJ4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP17L13C9JLJ4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP17L13C9JLJ4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP17L13C9JLJ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP17L13C9JLJ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP17L13C9JLJ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP17L13C9JLJ4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP17L13C9JLJ4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP17L13C9JLJ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms