Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
B4DEV8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
B4DEV8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DEV8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DEV8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DEV8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DEV8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DEV8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DEV8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DEV8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DEV8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DEV8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DEV8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DEV8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
B4DEV8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B4DEV8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
B4DEV8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
B4DEV8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
B4DEV8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
B4DEV8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B4DEV8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B4DEV8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DEV8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DEV8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DEV8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DEV8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DEV8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DEV8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DEV8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DEV8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
B4DEV8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B4DEV8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B4DEV8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
B4DEV8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DEV8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DEV8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DEV8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DEV8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DEV8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DEV8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DEV8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DEV8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DEV8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DEV8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DEV8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
B4DEV8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DEV8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
B4DEV8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DEV8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B4DEV8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DEV8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DEV8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DEV8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DEV8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DEV8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DEV8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DEV8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DEV8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DEV8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DEV8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DEV8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DEV8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DEV8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DEV8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DEV8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DEV8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DEV8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DEV8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DEV8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DEV8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DEV8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DEV8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
B4DEV8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DEV8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B4DEV8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DEV8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DEV8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DEV8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
B4DEV8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
B4DEV8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
B4DEV8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
B4DEV8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
B4DEV8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
B4DEV8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
B4DEV8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
B4DEV8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
B4DEV8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
B4DEV8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
B4DEV8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
B4DEV8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
B4DEV8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
B4DEV8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
B4DEV8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
B4DEV8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
B4DEV8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
B4DEV8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
B4DEV8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
B4DEV8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
B4DEV8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
B4DEV8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms