Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALM2-AKAP2B1ALY0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PALM2-AKAP2B1ALY0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms