Protein–RNA interactions for Protein: A6NNB3

IFITM5, Interferon-induced transmembrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM5A6NNB3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFITM5A6NNB3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFITM5A6NNB3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFITM5A6NNB3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFITM5A6NNB3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFITM5A6NNB3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFITM5A6NNB3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFITM5A6NNB3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFITM5A6NNB3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFITM5A6NNB3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFITM5A6NNB3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFITM5A6NNB3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFITM5A6NNB3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFITM5A6NNB3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFITM5A6NNB3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFITM5A6NNB3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFITM5A6NNB3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms