Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TVP23AA6NH52 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TVP23AA6NH52 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TVP23AA6NH52 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TVP23AA6NH52 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TVP23AA6NH52 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms