Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C5orf60A6NFR6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C5orf60A6NFR6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C5orf60A6NFR6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C5orf60A6NFR6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C5orf60A6NFR6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms