Protein–RNA interactions for Protein: A6NCS4

NKX2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-6A6NCS4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-6A6NCS4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NKX2-6A6NCS4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-6A6NCS4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-6A6NCS4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-6A6NCS4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-6A6NCS4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-6A6NCS4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-6A6NCS4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-6A6NCS4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-6A6NCS4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-6A6NCS4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX2-6A6NCS4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-6A6NCS4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-6A6NCS4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX2-6A6NCS4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-6A6NCS4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-6A6NCS4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-6A6NCS4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-6A6NCS4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-6A6NCS4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-6A6NCS4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-6A6NCS4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-6A6NCS4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-6A6NCS4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-6A6NCS4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX2-6A6NCS4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms