Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BEST4Q8NFU0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms